Personendetails

Diese Vorlesung führt in den Umgang mit einer Shell ein.

- Es werden Unterschiede in der Shell zwischen unterschiedlichen Betriebssystemen besprochen.

- Es wird eine Arbeitsumgebung für weitere Lehrveranstaltungen eingerichtet.

- Grundlegende Unix Shell Befehle und Möglichkeiten werden vermittelt.

- Die Verbindung und der Umgang mit Linux Servern über Command Line Tools wird erklärt und geübt.

- Studierende lernen, eigene Shell Skripte zu schreiben.

Blended learning

Immanente Leistungsüberprüfung

Übungsaufgaben und schriftlicher Test

Theoretische Grundlagen in der Genom- und Transkriptomanalyse:

- Einführung in die Themenbereiche Genomik und Transkriptomik, inklusive der Erzeugung der Daten.

- Softwarelösungen und Algorithmen im Bereich Genomik und Transkriptomik

Praktische Analysebeispiele aus Genomik und Transkriptomik. Anwendung entsprechender bioinformatischer Werkzeuge für

- Qualitätskontrolle und Prozessierung von Sequenzierdaten

- Assemblieren von Genomen und Transkriptomen.

- Mappen (Alignen) von Sequenzdaten

- Spezialisierte Beispiele aus dem Themenbereich (z.B. scRNA-Seq, ChIP-Seq o. a.)

Blended learning, flipped classroom

Immanente Leistungsüberprüfung

Praktische Übungsaufgaben und schriftlicher Test